Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tph2Q8CGV2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tph2Q8CGV2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms