Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc73Q8CDM4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms