Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo43Q8CDI2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms