Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms