Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms