Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pm20d1Q8C165 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pm20d1Q8C165 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pm20d1Q8C165 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms