Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk3Q8BWQ5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk3Q8BWQ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms