Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scfd2Q8BTY8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scfd2Q8BTY8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scfd2Q8BTY8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scfd2Q8BTY8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scfd2Q8BTY8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.9 ms