Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Pbrm1Q8BSQ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pbrm1Q8BSQ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pbrm1Q8BSQ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms