Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl38Q8BSF5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl38Q8BSF5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms