Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rd3Q8BRE0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms