Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms