Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo28Q8BIG4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fbxo28Q8BIG4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms