Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms