Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pknox2Q8BG99 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pknox2Q8BG99 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pknox2Q8BG99 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms