Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AknaQ80VW7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
AknaQ80VW7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
AknaQ80VW7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
AknaQ80VW7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms