Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC44.63■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
NischQ80TM9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC44.62■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC44.58■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
NischQ80TM9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC44.51■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
NischQ80TM9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC44.48■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
NischQ80TM9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.7
NischQ80TM9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms