Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna12Q80SS5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna12Q80SS5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna12Q80SS5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms