Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClmQ7TSN2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms