Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prrc2bQ7TPM1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prrc2bQ7TPM1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prrc2bQ7TPM1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prrc2bQ7TPM1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms