Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sys1Q78S06 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms