Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eci3Q78JN3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eci3Q78JN3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eci3Q78JN3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eci3Q78JN3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eci3Q78JN3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eci3Q78JN3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eci3Q78JN3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eci3Q78JN3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eci3Q78JN3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms