Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cspg5Q71M36 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cspg5Q71M36 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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