Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SynmQ70IV5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SynmQ70IV5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SynmQ70IV5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SynmQ70IV5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms