Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms