Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March6Q6ZQ89 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
March6Q6ZQ89 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms