Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zc3h4Q6ZPZ3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h4Q6ZPZ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms