Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ift172Q6VH22 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ift172Q6VH22 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms