Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NfrkbQ6PIJ4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfrkbQ6PIJ4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms