Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pabpc4Q6PHQ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms