Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc2Q6PDG5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarcc2Q6PDG5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms