Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim37Q6PCX9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim37Q6PCX9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim37Q6PCX9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim37Q6PCX9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim37Q6PCX9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim37Q6PCX9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim37Q6PCX9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim37Q6PCX9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim37Q6PCX9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim37Q6PCX9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms