Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkab2Q6PAM0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab2Q6PAM0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prkab2Q6PAM0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab2Q6PAM0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms