Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp49Q6P9L4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms