Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thsd7bQ6P4U0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thsd7bQ6P4U0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7bQ6P4U0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms