Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atg2aQ6P4T0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg2aQ6P4T0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg2aQ6P4T0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms