Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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