Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV1

Fam196b, Protein FAM196B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196bQ6GQV1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam196bQ6GQV1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam196bQ6GQV1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam196bQ6GQV1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms