Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Smarca2Q6DIC0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Smarca2Q6DIC0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC37.38■■■■□ 3.58
Smarca2Q6DIC0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Smarca2Q6DIC0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms