Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nop58Q6DFW4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nop58Q6DFW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms