Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltn1Q6A009 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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Ltn1Q6A009 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltn1Q6A009 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
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