Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd1cQ69ZK6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd1cQ69ZK6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd1cQ69ZK6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd1cQ69ZK6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd1cQ69ZK6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd1cQ69ZK6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms