Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sbno1Q689Z5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sbno1Q689Z5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbno1Q689Z5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
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