Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vat1Q62465 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vat1Q62465 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms