Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp1Q62442 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms