Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smad2Q62432 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smad2Q62432 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smad2Q62432 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad2Q62432 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad2Q62432 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad2Q62432 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smad2Q62432 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad2Q62432 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smad2Q62432 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smad2Q62432 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad2Q62432 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad2Q62432 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad2Q62432 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad2Q62432 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad2Q62432 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smad2Q62432 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smad2Q62432 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad2Q62432 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad2Q62432 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad2Q62432 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad2Q62432 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad2Q62432 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smad2Q62432 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad2Q62432 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad2Q62432 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smad2Q62432 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad2Q62432 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad2Q62432 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad2Q62432 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad2Q62432 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad2Q62432 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smad2Q62432 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad2Q62432 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad2Q62432 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms