Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp1Q62209 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sycp1Q62209 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp1Q62209 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1346.2 ms