Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Npm1Q61937 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Npm1Q61937 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Npm1Q61937 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms