Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift88Q61371 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift88Q61371 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms