Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BcanQ61361 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BcanQ61361 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BcanQ61361 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcanQ61361 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcanQ61361 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BcanQ61361 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BcanQ61361 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcanQ61361 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BcanQ61361 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BcanQ61361 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcanQ61361 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcanQ61361 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcanQ61361 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcanQ61361 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BcanQ61361 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcanQ61361 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcanQ61361 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcanQ61361 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BcanQ61361 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BcanQ61361 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms